Forum www.biotechugamg.fora.pl Strona Główna www.biotechugamg.fora.pl
Forum studentów biotechnologii UG/AMG
 
 FAQFAQ   SzukajSzukaj   UżytkownicyUżytkownicy   GrupyGrupy   GalerieGalerie   RejestracjaRejestracja 
 ProfilProfil   Zaloguj się, by sprawdzić wiadomościZaloguj się, by sprawdzić wiadomości   ZalogujZaloguj 

metody szacowania wydajnośc ekspresji genów

 
To forum jest zablokowane, nie możesz pisać dodawać ani zmieniać na nim czegokolwiek   Ten temat jest zablokowany bez możliwości zmiany postów lub pisania odpowiedzi    Forum www.biotechugamg.fora.pl Strona Główna -> 2009/2010 / Pracownia inżynierii genetycznej
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
Gosia




Dołączył: 12 Paź 2007
Posty: 846
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 36 razy
Ostrzeżeń: 0/5
Skąd: Ełk

PostWysłany: Pon 21:27, 26 Paź 2009    Temat postu: metody szacowania wydajnośc ekspresji genów

zna ktoś jakieś?
bo ja nie wiem nawet gdzie szukać a że nie mam netu ogólnie to nie mam gdzie szukać. Albo jak ktoś wie gdzie to jest w tych materiałach ;p
POMÓŻCIE!!!


Post został pochwalony 0 razy
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
Jakub
Moderator



Dołączył: 11 Paź 2007
Posty: 298
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 12 razy
Ostrzeżeń: 1/5
Skąd: Koszalin

PostWysłany: Pon 21:29, 26 Paź 2009    Temat postu:

A co to jest lacZ assay, bo tego też nie mogę znaleźć.

Wiek ktoś na czym polega indukcja ekspresji szokiem termicznym?

Czy OD=1 to to samo co 1 w skali McFarlanda. Bo jeśli tak, to wiem ile to jest CFU, a jeśli nie to nie wiem jak to znaleźć Razz

Kolejna KASZANA w tygodniu. Chyba otworzę mięsny.


Post został pochwalony 1 raz

Ostatnio zmieniony przez Jakub dnia Pon 21:30, 26 Paź 2009, w całości zmieniany 1 raz
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
grzesiek




Dołączył: 11 Paź 2007
Posty: 208
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 5 razy
Ostrzeżeń: 0/5

PostWysłany: Pon 21:45, 26 Paź 2009    Temat postu:

badanie ekspresii:
blot (Northern i Western) - Western tylko do analizy produktu jednego genu
RT-RCR i później qPCR - tylko do analizy produktu jednego genu
mikromacierze do badania mRNA
GFP dodane do białka
ELISA

podaje za angielskim wiki, ale brzmi sensownie

link do skali McFarlanda
[link widoczny dla zalogowanych]

a indukcja ekspresji szokiem termicznym jak dla mnie jest to indukcja genu na promotorze genu odpowiedzi na stres...


Post został pochwalony 1 raz

Ostatnio zmieniony przez grzesiek dnia Pon 21:50, 26 Paź 2009, w całości zmieniany 2 razy
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
Jakub
Moderator



Dołączył: 11 Paź 2007
Posty: 298
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 12 razy
Ostrzeżeń: 1/5
Skąd: Koszalin

PostWysłany: Pon 21:52, 26 Paź 2009    Temat postu:

Dzięki Grzesiek. Chodzi jednak o to, czy skala McFarlanda to jest to samo, co podaje nam densytometr, albo spektrofotometr ustawiony na badanie OD.

RT-PCR? Real-Time PCR czy Reverse Transcriptase PCR?


Post został pochwalony 0 razy

Ostatnio zmieniony przez Jakub dnia Pon 21:54, 26 Paź 2009, w całości zmieniany 1 raz
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
grzesiek




Dołączył: 11 Paź 2007
Posty: 208
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 5 razy
Ostrzeżeń: 0/5

PostWysłany: Pon 21:57, 26 Paź 2009    Temat postu:

z tego co jest w tej tabelce z linka to nie... tam na dole jest w niej absorbancja podana... i wychodzi ze jeden u McFarlanda to 3*10^8 CFU/ml
chyba ze czegos dalej nie rozumiem Razz


Post został pochwalony 0 razy

Ostatnio zmieniony przez grzesiek dnia Pon 21:57, 26 Paź 2009, w całości zmieniany 1 raz
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
Jakub
Moderator



Dołączył: 11 Paź 2007
Posty: 298
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 12 razy
Ostrzeżeń: 1/5
Skąd: Koszalin

PostWysłany: Pon 22:00, 26 Paź 2009    Temat postu:

Tak - to by się zgadzało. Znalazłem tablekę w której dokładnie to było podane.
1 w skali McFarlanda to było 300*10^6 CFU/ml


Post został pochwalony 0 razy
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
grzesiek




Dołączył: 11 Paź 2007
Posty: 208
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 5 razy
Ostrzeżeń: 0/5

PostWysłany: Pon 22:03, 26 Paź 2009    Temat postu:

RT-PCR to Reverse Tanscriptase PCR
qPCR to Real Time PCR (ewentualnie qantitative Real Time PCR)


Post został pochwalony 0 razy

Ostatnio zmieniony przez grzesiek dnia Pon 22:04, 26 Paź 2009, w całości zmieniany 2 razy
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
Mandragora




Dołączył: 13 Cze 2008
Posty: 16
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 3 razy
Ostrzeżeń: 0/5

PostWysłany: Wto 21:38, 27 Paź 2009    Temat postu:

lacZ assay: [url]http://openwetware.org/wiki/Beta-Galactosidase_Assay_(A_better_Miller)[/url]

Post został pochwalony 1 raz

Ostatnio zmieniony przez Mandragora dnia Wto 22:38, 27 Paź 2009, w całości zmieniany 1 raz
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
Ailin




Dołączył: 11 Paź 2007
Posty: 311
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 12 razy
Ostrzeżeń: 0/5

PostWysłany: Śro 0:27, 28 Paź 2009    Temat postu:

oj wy panowie coś zupełnie pokręciliście, skala McFarlanda ni jak sie ma do OD

1OD=1*10^9 komórek/ml - dokładnie tego uczyli nas na biologii molekularnej, nawet zadania na to były na wejściówkach Razz


Post został pochwalony 0 razy
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
n3l




Dołączył: 10 Paź 2007
Posty: 448
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 28 razy
Ostrzeżeń: 0/5

PostWysłany: Śro 0:45, 28 Paź 2009    Temat postu:

Ja gdzies znalazlam ze 1OD= 1*10^9 komorek w 1ml Smile ale nie wiem czy to prawda i nie odpowiadam za to:P

Post został pochwalony 0 razy
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
Cień




Dołączył: 19 Paź 2007
Posty: 434
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 15 razy
Ostrzeżeń: 0/5

PostWysłany: Nie 23:29, 01 Lis 2009    Temat postu:

Mandragora napisał:
lacZ assay: [url]http://openwetware.org/wiki/Beta-Galactosidase_Assay_(A_better_Miller)[/url]


tak wogole to cos podobnego bylo na labach z biolmola - przy pomiarze indukcji ogolnej odpowiedzi na stres.


Post został pochwalony 0 razy
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Zobacz poprzedni temat :: Zobacz następny temat  
Autor Wiadomość
grzesiek




Dołączył: 11 Paź 2007
Posty: 208
Przeczytał: 0 tematów

Pomógł: 5 razy
Ostrzeżeń: 0/5

PostWysłany: Pon 23:02, 02 Lis 2009    Temat postu:

ale nikt nie mowi ze OD nie rowna sie 1*10^9, my mowilismy o skali McFarlanda Razz

Post został pochwalony 0 razy
Powrót do góry
Zobacz profil autora
Wyświetl posty z ostatnich:   
To forum jest zablokowane, nie możesz pisać dodawać ani zmieniać na nim czegokolwiek   Ten temat jest zablokowany bez możliwości zmiany postów lub pisania odpowiedzi    Forum www.biotechugamg.fora.pl Strona Główna -> 2009/2010 / Pracownia inżynierii genetycznej Wszystkie czasy w strefie EET (Europa)
Strona 1 z 1

 
Skocz do:  
Nie możesz pisać nowych tematów
Nie możesz odpowiadać w tematach
Nie możesz zmieniać swoich postów
Nie możesz usuwać swoich postów
Nie możesz głosować w ankietach

fora.pl - załóż własne forum dyskusyjne za darmo
Powered by phpBB © 2001, 2005 phpBB Group
Regulamin