www.biotechugamg.fora.pl

Wojtek

[link widoczny dla zalogowanych]

Robert

ej, zróbmy giełdy!

i niech te osoby mające giełdy z 2008 (?) roku wrzucą je na pocztę

ja pamiętam takie pytania:

czy zaznaczone coś na drzewie jest kladem
wyjaśnij co to paralogi
wyjaśnij co to ortologi
napisane drzewo nawiasami (a, (b,c)), narysować je normalnie
ukorzenić drzewo
normalne drzewo napisać tymi nawiasami
narysuj wykres ilości pairwise mutations od czasu oddzielenia się gatunków + wyjaśnij dlaczego tak
czy wszystkie pozytywne mutacje się zafixują?
co to fixacja?
czy zgodnie z prawie-neutralną teorią ewolucji lekko-negatywne mutacje zostaną wyeliminowane?
drzewo filogenetyczne: nałożone na siebie drzewo gatunku i takie molekularne - narysować obok samo molekularne i powiedzieć, czy jest takie samo jak filogenetyczne (jest na jednym ze slajdów)
czy zaznaczone linie na drzewie są siostrzane?

Wojtek

Na podstawie drzewa, napisać czy dany organizm jest bliżej spokrewniony z tym czy z innym. Z danych organizmów wybrać taksonomy siostrzane.
Co to jest pseudogen
Porównano sekw 2 enzymów, stwierdzono 5 zmianw aminokwasach i 7 zmian na poziomie nukleotydów. Napisać i wyjaśnić, czy działała selekcja pozytywna, negatywna, czy też jest to efektem mutacji neturalnych.
Jeżeli mutacje zachodzą losowo, będzie więcej tranzycji czy transwersji?
Wyjaśnić pojęcie Resolving adaptive conflict w kontekście białek.
Napisać czym są prasimony informative characters, podać przykład 4 sekwencji nukleotydowych, zaznaczyć co i jak i zrobić drzewo (chyba jakoś tak to było)
2 kolonie bakteryjne hodowano w różnych warunkach. Z grubsza, zpierwszej z prób pobierano co 24h losową próbkę i zaszczepiano na nowo płynną pożywkę. Powtórzono tak sto razy. Z drugiej hodowli prowadzonej początkowo tak samo pobierano próbkę, którą posiewano na podłoże stałe, wybierano pojedynczą kolonię którą zaszczepiano na nowo pożywkę płynną. Taki manwer powtórzono 100 razy.
Po tych 100 razach mierzono fitness obu bakterii (tak jak na slajdach z wykładu). napisać która z bakterii wygryzie którą jeśli w ogóle jesteśmy w stanie to stwierdzić i dlaczego

Lukasz

Po co robić giełdy, jak i tak trafiają one później tylko do wybranych, jak te z 2008 roku?

Robert

nie, te trafią do wszystkich, moja w tym głowa ;]

Ania

czy by mogl ktos wrzucic gieldy z 2008 roku na maila grupowego??????????????????????????????????????? Smile